Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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