Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms