Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc29Q80VM3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms