Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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