Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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