Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms