Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms