Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms