Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms