Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
GscQ02591 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GscQ02591 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms