Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms