Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gabpb2P81069 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gabpb2P81069 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms