Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms