Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b6P59708 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b6P59708 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b6P59708 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms