Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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