Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BgnP28653 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms