Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms