Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sp100O35892 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms