Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms