Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms