Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4787B2RUD9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4787B2RUD9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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