Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms