Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Col5a3Q9JLI2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Col5a3Q9JLI2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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