Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trim39Q9ESN2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms