Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC48

Cdc40, Pre-mRNA-processing factor 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc40Q9DC48 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc40Q9DC48 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdc40Q9DC48 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdc40Q9DC48 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdc40Q9DC48 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdc40Q9DC48 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdc40Q9DC48 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc40Q9DC48 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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