Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf6Q9D4J7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms