Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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