Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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