Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb1Q9CPU1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms