Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tdrd1Q99MV1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms