Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms