Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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