Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lin52Q8CD94 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms