Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nek5Q7TSC3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms