Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms