Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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