Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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