Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC061212Q6P8K3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC061212Q6P8K3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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