Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spty2d1Q68FG3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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