Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms