Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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