Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nom1Q3UFM5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms