Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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