Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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