Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Tff1Q08423 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tff1Q08423 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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