Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msx2Q03358 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms