Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms