Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irx1P81068 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Irx1P81068 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Irx1P81068 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Irx1P81068 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms