Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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