Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp25P57080 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp25P57080 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp25P57080 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp25P57080 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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